Vila Nova de Milfontes situa-se na costa ocidental do Oceano Atlântico na margem norte do rio Mira, inserida no Parque Natural do Sudoeste Alentejano e Costa Vicentina. Vila Nova de Milfontes é dominada por um grande estuário e ecossistema, dominado pelo rio Mira que dá abrigo a várias espécies de aves e vida marinha, além de javalis e raposas nas matas circundantes.
